厦门南洋学院据2020年2月学校官网显示，学校设有8个二级学院和思想政治教育研究部，开设46个专业，涵盖装备制造、土木建筑、电子信息、财经商贸、旅游、文化艺术等高职教育专业大类，其中工科专业25个，形成了先进制造技术、电子信息技术、现代服务与管理、文化艺术、土建、财经、商贸等7大专业群。